親鸞聖人（1173-1263）的御廟位於如來堂的西邊。親鸞聖人是淨土真宗的開宗祖師。親鸞聖人的遺骨分葬於日本多座淨土真宗寺院之中——他的五顆牙齒就安葬在專修寺。

御廟拜堂是御廟內的大堂，用來舉辦追思法會。這座小建築有著華麗的大屋頂，外部裝飾華麗，有著精緻華美的鳥獸花草雕刻。和外部相比，內部則顯得樸素無華。

入口屋頂是一道弧形曲線樣式（唐破風），在其上頭以及建築物後方有陡峭的三角形山牆。所有山牆下方都飾以松樹與竹林中的鳥類，以及菊花、蓮花和牡丹等雕刻圖案。菊花在屋瓦和金屬製品上格外醒目。唐破風的頂部有一座金屬孔雀雕塑。

親鸞聖人於1262年1月16日圓寂，作為親鸞聖人追思法會儀式的一部分，僧侶們每月16日都會前往御廟拜堂祭拜。