Il portale Sanmon è l'ingresso principale del tempio e segna la separazione tra il sacro spazio del tempio e il mondo profano esterno. Il piano superiore chiuso del Sanmon del Senjuji contiene uno spazio per il culto, dove sono custodite le immagini di Shakyamuni (il Buddha storico) e di due suoi assistenti.

Il Sanmon del Senjuji è costruito nello stile più formale per questo tipo di portale, integrando il Mieidō direttamente dall'altra parte del cortile. La struttura del portale è sostenuta da cinque file di sei pilastri, creando cinque campate aperte. Per "campata" si intende la larghezza tra le colonne principali, uno spazio di poco inferiore ai 2 metri. Ciascuna delle tre campate al centro del portale è dotata di una serie di spesse porte doppie in legno.

Il livello inferiore del Sanmon sostiene la parte superiore tramite bracci a mensola inseriti nei pilastri principali, anziché tramite un blocco di supporto sulla parte superiore dei pilastri. È simile al Sanmon del tempio Tōfukuji di Kyoto (costruito nel 1425), ma l'estensione della grondaia sulle tre campate centrali sul lato interno del portale è unica del Senjuji.

La costruzione del portale iniziò nel 1693 e fu completata nel 1704. Queste date sono note grazie alle iscrizioni sulle tegole del tetto scoperte durante i lavori di ristrutturazione durati tre anni e iniziati nel 1993. Il portale è largo 20 metri, profondo 9 metri e alto 15,5 metri.