ประตูซันมงคือประตูทางเข้าหลักของวัดซึ่งเป็นสัญลักษณ์ของการแบ่งแยกอาณาเขตศักดิ์สิทธิ์ของวัดจากโลกภายนอก ชั้นบนของประตูซันมงวัดเซ็นจุจิเป็นพื้นที่ปิดสำหรับสักการะและประดิษฐานพระศากยมุนี (พระพุทธเจ้าองค์ประวัติศาสตร์) และพระอัครสาวกสององค์
ประตูซันมงของวัดเซ็นจุจิสร้างขึ้นในรูปแบบที่เป็นทางการที่สุดสำหรับประตูประเภทนี้ ซึ่งสอดคล้องกับวิหารมิเอโดที่ตั้งอยู่ฝั่งตรงข้ามลาน ประตูนี้มีโครงสร้างที่ค้ำยันด้วยเสา 5 แถว แถวละ 6 ต้น ทำให้เกิดช่องเปิดทั้งหมดห้าช่อง "ช่อง" หมายถึงความกว้างระหว่างเสาหลัก ซึ่งมีระยะห่างน้อยกว่า 2 เมตรเล็กน้อย ช่องสามช่องตรงกลางประตูแต่ละช่องมีประตูไม้คู่หนา
ส่วนล่างของประตูซันมงรองรับส่วนบนด้วยการใช้คานค้ำยันที่สอดผ่านเสาหลัก แทนที่จะใช้แท่นรองรับที่อยู่ด้านบนของเสา ลักษณะนี้คล้ายกับประตูซันมงของวัดโทฟุคุจิในเกียวโต (สร้างในปี ค.ศ. 1425) แต่ส่วนชายคาที่ยื่นออกไปเหนือช่องกลางสามช่องด้านในของประตูนั้นเป็นเอกลักษณ์เฉพาะของวัดเซ็นจุจิ
การก่อสร้างประตูนี้เริ่มต้นในปี ค.ศ. 1693 และเสร็จสิ้นในปี ค.ศ. 1704 วันที่เหล่านี้ทราบจากการจารึกบนกระเบื้องหลังคาที่ถูกค้นพบในระหว่างการบูรณะที่กินเวลาสามปีซึ่งเริ่มขึ้นในปี ค.ศ. 1993 ประตูมีความกว้าง 20 เมตร, ลึก 9 เมตร, และสูง 15.5 เมตร