专修寺的大门建于1704年，位于御影堂的正前方。采用五间三户二层二重门的格局，属于最高规格的寺院大门设计，是日本指定的重要文化遗产。

山门前修筑的石板路，一直延伸至远方，将沿路的石桥、钉拔门、和分立左右的玉保院、智慧光院串联起来，与古老的街道融为一体，一切都符合灵山古刹山门应有的氛围。

山门为2层建筑，宽20米，深9米，高15.5米。正面柱子之间的空间被分为五间，其中三间安装了门作为入口，二楼室内安放着释迦三尊像。 下层的斗拱组采用“大佛样”形式，将承重的“插肘木”直接插在柱子上。整体结构设计时应该参考了京都的国宝——建于应永12年（1405年）的东福寺三门，尽管两者相似，但是山门里侧的屋顶仅有三间宽度突出属于十分罕见的建筑手法。

根据瓦上的刻铭及其他资料记载，山门于元禄6年（1693年）左右开始动工建造，并于宝永元年（1704年）左右完成。由于柱子等部件的损坏及倾斜度的加剧，山门于平成5年（1993年）开始，花了3年时间进行了大规模修缮。